缺点如下：

1、马自达6AT变速箱在一些情况下换挡时会出现顿挫感，尤其是在低速行驶和启动时更为明显。这不仅影响了驾驶的舒适性，也会对车辆的性能产生一定的影响。

2、马自达6AT变速箱的油耗高。这款变速箱采用了先进的技术，包括快速换挡和智能化控制系统，但其油耗表现并不理想。在城市道路上行驶时，其油耗会高于同级别竞品，这会给车主带来经济压力。